資源差額開票的申報流程主要包括填寫《增值稅納稅申報表附列資料（一）》和《增值稅納稅申報表附列資料（三）》、錄入扣除額以及進(jìn)行賬務(wù)處理等步驟。以下是詳細(xì)的流程說明： 填寫《增值稅納稅申報表附列資料（一）》：將開具發(fā)票的不含稅銷售額及稅額填入相應(yīng)欄目。具體來說，如果選擇簡易計稅方法，則在第5行第1和第2列分別填入銷售額和銷項(xiàng)稅額；在第5行第12列填入服務(wù)、不動產(chǎn)和無形資產(chǎn)扣除項(xiàng)目本期實(shí)際扣除金額。 填寫《增值稅納稅申報表附列資料（三）》：按增值稅發(fā)票價稅合計填入第3行“6%稅率的項(xiàng)目（不含金融商品轉(zhuǎn)讓）”第1列“本期服務(wù)、不動產(chǎn)和無形資產(chǎn)價稅合計額（免稅銷售額）”；將代支付的費(fèi)用填入第3行第3列“本期發(fā)生額”欄次。 錄入扣除額：在開具發(fā)票時，通過新系統(tǒng)中差額征稅開票功能，錄入含稅銷售額和扣除額，系統(tǒng)會自動計算稅額和不含稅金額，并在備注欄自動打印“差額征稅”字樣。 進(jìn)行賬務(wù)處理：根據(jù)差額征稅政策，允許從銷售額中扣除其支付給非試點(diǎn)納稅人價款的部分，應(yīng)在“應(yīng)交稅費(fèi)--應(yīng)交增值稅”科目下增設(shè)“營改增抵減的銷項(xiàng)稅額”專欄，用于記錄該企業(yè)因按規(guī)定扣減銷售額而減少的銷項(xiàng)稅額。同時，“主營業(yè)務(wù)收入”、“主營業(yè)務(wù)成本”等相關(guān)科目應(yīng)按經(jīng)營業(yè)務(wù)的種類進(jìn)行明細(xì)核算。