首先，我們需要明確增值稅的免稅政策以及發(fā)票開具的相關(guān)規(guī)定。 (1) 對于甲企業(yè)把蔬菜去皮、切丁、裝盒后銷售給自己門店（個體工商戶）的情況： 甲企業(yè)從農(nóng)民處購入的蔬菜，如果取得了免稅發(fā)票，說明這些蔬菜本身是免稅的。但是，當甲企業(yè)對蔬菜進行了加工（去皮、切丁、裝盒）后，這些蔬菜已經(jīng)不再是初級農(nóng)產(chǎn)品，而是經(jīng)過加工的農(nóng)產(chǎn)品。根據(jù)增值稅的規(guī)定，經(jīng)過加工的農(nóng)產(chǎn)品通常不再享受免稅政策。 因此，甲企業(yè)銷售給自己門店的經(jīng)過加工的蔬菜，不能開具免稅發(fā)票，而應(yīng)該按照一般規(guī)定開具增值稅發(fā)票，并繳納相應(yīng)的增值稅。 (2) 對于甲企業(yè)把蔬菜去皮、切丁、裝盒后銷售給A企業(yè)(一般納稅人)的情況： 同樣地，甲企業(yè)銷售給A企業(yè)的經(jīng)過加工的蔬菜也不能開具免稅發(fā)票。A企業(yè)作為一般納稅人，需要按照一般規(guī)定進行增值稅的抵扣和繳納。 針對A企業(yè)購入后加工并銷售的情況： a：A企業(yè)購入后加工，銷售13%： A企業(yè)購入的經(jīng)過加工的蔬菜，由于不是免稅產(chǎn)品，所以A企業(yè)在銷售時需要按照適用的稅率（假設(shè)為13%）計算并繳納增值稅。 b：如果甲企業(yè)可以開免稅發(fā)票，A企業(yè)是否可以收取？后按照10%計算抵扣？ 由于我們已經(jīng)確定甲企業(yè)不能對經(jīng)過加工的蔬菜開具免稅發(fā)票，所以這個問題的前提不成立。但如果我們假設(shè)甲企業(yè)能夠開具免稅發(fā)票（這在實際情況中是不可能的），A企業(yè)也不能直接按照10%的稅率計算抵扣。因為A企業(yè)購入的蔬菜已經(jīng)經(jīng)過加工，不再是免稅的初級農(nóng)產(chǎn)品，所以A企業(yè)不能享受初級農(nóng)產(chǎn)品的抵扣政策。A企業(yè)需要根據(jù)自己銷售的產(chǎn)品和適用的稅率來計算和繳納增值稅。