加計扣除憑證的做法如下： 1、依據增值稅發(fā)票，依據地方稅務總局發(fā)布的消費稅發(fā)票，登記增值稅及地方消費稅以及其它應稅項目。 2、按照稅收識別號和購買方歸類記賬，在增值稅科目下登記增值稅，在消費稅科目下登記消費稅，在其它稅收科目下登記其它應稅項目，并登記住房公積金。 3、依據《企業(yè)所得稅暫行條例》和《企業(yè)所得稅抵減清算辦法》，登記企業(yè)稅收減免，識別減稅科目，并準確記賬。 4、結合稅收減免政策，登記可以減免費用，以便記賬使用。 5、根據稅收減免政策，記賬減免項目，并登記稅收減免稅款。 以上就是加計扣除憑證的做法。有人想要深入了解，可以參閱《企業(yè)所得稅暫行條例》、《企業(yè)所得稅抵減清算辦法》及其它相關法規(guī)，并要熟練掌握具體的減稅規(guī)定。