是的，抵扣的增值稅在企業(yè)所得稅應(yīng)納稅額中不得進(jìn)行扣除。抵扣的增值稅主要是指企業(yè)的進(jìn)項(xiàng)稅額，包括購買原材料、向供應(yīng)商和勞務(wù)商付款所產(chǎn)生的稅費(fèi)，在根據(jù)有關(guān)稅收管理規(guī)定，從增值稅申報(bào)的稅款中抵扣的稅費(fèi)。根據(jù)《企業(yè)所得稅法》規(guī)定，企業(yè)的收入和費(fèi)用項(xiàng)應(yīng)當(dāng)按賬面價(jià)值計(jì)算，不得有抵扣項(xiàng)目，因此，抵扣的增值稅不應(yīng)當(dāng)被計(jì)入企業(yè)所得稅應(yīng)納稅額中。拓展知識(shí)：抵扣增值稅原則上是企業(yè)在已經(jīng)交納過的稅款中進(jìn)行抵扣，減少企業(yè)本次稅費(fèi)，但由于存在企業(yè)惡意逃稅等情況，對(duì)其嚴(yán)格管理，目前在抵扣增值稅方面均要求企業(yè)按照真實(shí)情況及時(shí)申報(bào)，確保增值稅的有效管理。