你好，首先是流程的區(qū)別，直接支付直接上報財政局國庫支付中心，授權(quán)支付需要先向財政部申請財政授權(quán)支付用款額度，其次是指令簽發(fā)方區(qū)別，直接支付由財政部門向中國人民銀行和代理銀行簽發(fā)支付指令，而授權(quán)支付由預(yù)算單位按照財政部門的授權(quán)，自行向代理銀行簽發(fā)支付指令。