根據(jù)合伙企業(yè)法，合伙人在合伙企業(yè)與第三人的關系中確實有義務保護第三人的合法權益。合伙人作為合伙企業(yè)的股東，享有合伙企業(yè)的利益，但同時也承擔著相應的義務和責任。合伙人應當遵守合伙協(xié)議中的約定，履行誠實守信、忠實盡責的義務，不得損害合伙企業(yè)和其他合伙人的利益，也不得損害第三人的合法權益。

在與第三人的合作中，合伙人應當以誠實、公平、公正的原則對待第三人，不得以不正當手段或者不公平競爭的方式損害第三人的合法權益。如果合伙人違反了合作協(xié)議，導致第三人遭受損失，第三人有權要求合伙人承擔相應的賠償責任。

此外，合伙人還有義務保護合伙企業(yè)的聲譽和信譽，不得從事?lián)p害合伙企業(yè)聲譽的行為，否則可能對合伙企業(yè)造成重大損失。

總之，合伙人在合伙企業(yè)與第三人關系中應當盡力保護第三人的合法權益，遵守誠實守信、公平公正的原則，履行合伙協(xié)議中的約定，以維護合伙企業(yè)和其他合伙人的利益為前提。