首先，雙方應(yīng)進(jìn)行充分的溝通和協(xié)商?？偘鼏挝粦?yīng)向分包單位清晰說(shuō)明整個(gè)業(yè)務(wù)流程以及財(cái)務(wù)處理的依據(jù)，解釋進(jìn)項(xiàng)稅轉(zhuǎn)出的原因，并強(qiáng)調(diào)按照正常流程和財(cái)務(wù)規(guī)范，分包單位應(yīng)當(dāng)開(kāi)具已扣除運(yùn)費(fèi)的計(jì)量發(fā)票。 如果協(xié)商無(wú)果，總包單位可以依據(jù)雙方簽訂的合同條款來(lái)解決爭(zhēng)議。查看合同中對(duì)于此類情況是否有明確的約定，如費(fèi)用的承擔(dān)、發(fā)票的開(kāi)具等，按照合同約定執(zhí)行。 若合同中沒(méi)有相關(guān)明確約定，雙方可以共同尋求第三方專業(yè)機(jī)構(gòu)的幫助，如咨詢財(cái)務(wù)顧問(wèn)、法律專家等，獲取專業(yè)的意見(jiàn)和建議，以確定合理的解決方案