生產企業(yè)免稅、抵稅和退稅的處理包括：一是根據國家有關法律、法規(guī)和規(guī)定，按規(guī)定享受稅收優(yōu)惠；二是根據國家有關稅收優(yōu)惠政策，申請抵減稅收；三是依據稅收優(yōu)惠的規(guī)定，申請退稅。