在公司租入土地自建廠房時，是否要辦理房產證和入固定資產科目取決于您的情況。根據中華人民共和國房地產管理法，購買或租賃的建筑物及構筑物，如果想要取得所有權，就需要辦理房產證。而如果您僅僅是租賃該土地或廠房，那么就無需辦理房產證，但是如果想要辦理房產證，則可以向當地的房地產管理部門申請辦理。另外，如果您自建廠房，那么可以將入固定資產科目。由于固定資產科目只能把建造成本計入，所以入固定資產科目就可以實現這一目的。為了保證正確辦理固定資產科目，您應當向當地財政部門準確認知相關的流程，以及提交的必要申報資料，符合國家相關法律法規(guī)，從而保障所有資產的安全。 拓展知識：在處理房產和固定資產時，為了保障安全，您還應該考慮準備相關書面文件，例如房屋買賣合同，租賃合同，廠房建設申請書等，以便在辦理相關證件和登記時使用。