企業(yè)被罰留抵稅額，主要是因為企業(yè)沒有按時繳納所得稅、增值稅或營業(yè)稅。根據(jù)《中華人民共和國稅收征收管理法》，稅務機關可以對不按期繳稅者處以滯納金、罰款。稅務總局發(fā)布《申報抵扣稅額管理辦法》，要求企業(yè)把不抵扣的稅額，由會計師事務所進行登記，并定期向稅務機關申報留抵稅額，稅務機關審核確認后，將會將該稅額抵扣當期應繳稅額；如果企業(yè)未按規(guī)定報送申報或不能證明稅額的真實性，可能被罰款。 拓展知識：抵扣稅額是民企可以利用的一項稅收優(yōu)惠政策，只要企業(yè)提交了合法可行的資料，稅務機關將按照規(guī)定抵扣或調整稅款，并有效減輕了企業(yè)的稅負。