是的，公司可以在9月份補記做賬務(wù)處理。根據(jù)《財政部 國家稅務(wù)總局關(guān)于進一步明確小規(guī)模納稅人稅收征收管理有關(guān)事項的通知》（財稅〔2013〕60號），小規(guī)模納稅人可以補記減免稅金，補記的具體時間，可以在征收機關(guān)審核及準予減免稅金的申報材料后的1個自然月內(nèi)，依據(jù)稅務(wù)機關(guān)給出的減免稅金證明補記減免稅金。這里有兩點需要注意：首先，小規(guī)模納稅人補記減免稅金，稅源所在期間必須已經(jīng)在申報和納稅完成；其次，補記減免稅金不能超過當期實際應(yīng)納稅額。 其實，納稅人補記減免稅金也是一種財務(wù)計提的方式，可以使財務(wù)回歸到正軌，有利于財務(wù)會計記賬的更準確、更合理。因此，在做減免稅的時候也要注意會計準則以及相關(guān)征管規(guī)定，避免操作失誤，確保財務(wù)會計記賬準確無誤。