根據(jù)《中華人民共和國發(fā)票管理條例》的規(guī)定，法人名下的兩個公司的其他往來款一般是可以用發(fā)票沖抵的，但是需要符合下列條件：首先，必須是雙方在價款金額、結算方式、貨物或服務等均有調節(jié)的情況下共同達成的約定；其次，法定代表人或負責人能夠證明發(fā)票與兩家公司之間的往來款項有一定的關聯(lián)；再次，被沖銷的發(fā)票須具備是有效發(fā)票，且兩家公司之間的結算應已稅種、稅額和實收金額確定，以及雙方雙邊確認出具發(fā)票，并且實施了實物貨物或服務的供應及收費。否則，就存在可能無法沖抵的可能性。 此外，在雙方所簽訂的合同中，要明確指出發(fā)票的沖抵權以及必要的稅收申報要求，以及相關的核查程序。以免出現(xiàn)后期經(jīng)營過程中因著發(fā)票抵沖的原因而發(fā)生爭議，造成雙方的經(jīng)濟損失。