公司代扣代繳個稅，1月份申報個稅繳納金額1743元，已經(jīng)繳納了稅費(fèi)，但是1月份又更新了申報，填了專項(xiàng)附加3000，更新后繳納稅費(fèi)1653，是不是多交了90，但是這筆錢已經(jīng)從員工工資里扣了90，2月份申報的時候，沒有填專項(xiàng)附加扣除，且該員工后續(xù)都沒有這3000的專項(xiàng)附加了，該員工2月實(shí)際工資18750，社保694.85，算稅應(yīng)該是((18750-684.85)-5000)x0.03=391.96，實(shí)際公司代扣代繳時繳納481.96，但是該員工的工資還是按照391.96扣除后支付的，現(xiàn)在是公司的錢多付了90嗎，應(yīng)該怎么做，是從員工工資里在扣90，還是需要去稅務(wù)局辦理退稅，還是可以用來抵扣3月份的個稅，能分析一下嗎